帶正電荷的 Nanogold®可以參與許多不同的標記反應。

如果您想要綴合的分子具有羧酸基團（例如肽中的C端），您可以使用肽合成中使用的反應將其與帶正電荷的納米金綴合：使用EDC（ 1-乙基）激活羧酸-3-[3-二甲基氨基丙基]碳二亞胺鹽酸鹽)和磺基-NHS；您可以從多種來源購買 EDC。 EDC 與待標記分子上的羧基反應，形成胺反應性 O-酰基異脲中間體。該中間體容易水解，使其在水溶液中的壽命較短。添加磺基-NHS (5 mM) 通過將胺反應性中間體轉化為胺反應性磺基 -NHS 酯來穩定胺反應性中間體，從而提高 EDC 介導的偶聯反應的效率。這種活化的磺基-NHS 酯隨后很容易與氨基反應。

或者，帶正電的 Nanogold® 上的氨基可以使用交聯劑激活。顯示了兩個示例。首先，使用水溶性同雙功能交聯劑雙（磺基-琥珀酰亞胺基）辛二酸酯（BS3） 來綴合肽的N端，其中C端已被保護。該過程的一個特點是它提供了相對較長的鏈接：BS3 的 C8 鏈被添加到帶有胺的丙基上，該胺突出到 Nanogold® 顆粒配體殼的外表面之外。在第二個方案中，水溶性異雙功能交聯劑，磺基-琥珀酰亞胺基 4-[ N-馬來酰亞胺基-甲基]-環己烷-1-羧酸酯 ( Sulfo -SMCC)，用于將胺與馬來酰亞胺基團選擇性地與硫醇反應。然后使用馬來酰亞胺衍生物來標記硫醇化生物分子，例如含有半胱氨酸的肽。多種其他交聯劑可用于將胺連接至不同的官能團；